Skip to main content

Advertisement

Table 4 Recombination analysis between Singapore and Guangdong strains

From: Molecular characterization and phylogenetic analysis of dengue virus type 1 in Guangdong in 2014

Strain NT position Major parent Minor parent Av.P-Val methods
RDP GENECONV MaxChi Chimaera SiScan 3Sep
FJ196847-Guangdong-1997 994–1701 EU081274 FJ196842 4.882 × 10−9 4.852 × 10−9 8.131 × 10−9 3.788 × 10−9 3.350 × 10−17 3.844 × 10−40
2238–7197 EF025110 EU081234 3.415 × 10−13 7.161 × 10−10 7.79 × 10−19 3.318 × 10−19 1.389 × 10−28 9.458 × 10−48
7617–8231 A75711 FJ196846 1.04 × 10−2 3.721 × 10−4 1.21 × 10−4 9.047 × 10−5 9.28 × 10−9 2.032 × 10−4
8887–10675 FJ196844 FJ196846 6.537 × 10−25 7.002 × 10−23 3.198 × 10−10 1.354 × 10−7 7.451 × 10−35 4.79 × 10−13
FJ196848–Guangdong-1999 1187–1754 EU081274 FJ196842 4.882 × 10−9 4.582 × 10−9 80131 × 10−9 3.788 × 10−9 3.35 × 10−17 3.844 × 10−4
1626–5978 EF025110 EU081234 3.415 × 10−13 7.161 × 10−10 7.79 × 10−19 3.318 × 10−19 1.369 × 10−28 9.458 × 10−48
4604–4870 A75711 EU081258 4.921 × 10−3     2.891 × 10−5  
7995–8851 KF971869 FJ196847 1.061 × 10−2 1.681 × 10−4 1.286 × 10−2 2.253 × 10−3 4.58 × 10−13 2.699 × 10−2
8914–9201 GZ02 FJ196846 3.213 × 10−4 2.303 × 10−6    2.503 × 10−8  
EF032589-Guangdong-2004 1300–2514 EF025110 EU081234 3.415 × 10−13 7.161 × 10−10 7.79 × 10−19 3.318 × 10−19 1.369 × 10−28 9.458 × 10−48