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Table 2 Nuclear microsatellite alleles in base pairs, alleles arranged vertically by locus for Carya species from diverse geographic regions, presented by species within Section and hybrid group

From: ‘Jones hybrid’ hickory: a case study in Carya curation

Sample Section Spp State Accession cin22 cin13 cin20 cin4 cin23 ca10 ga38 ga39 ga41 wga242 wga118 wga321 wga4 A05
LJ06-49 apo cor LA 02-COR-LA-BF-1 117 126 141 99 83 133 111 112 122 207 177 221 248 110
      117 126 141 99 83 139 111 126 132 211 223 221 270 115
LJ06-50 apo cor LA 02-COR-LA-BF-2 117 126 141 90 74 133 111 110 100 209 165 223 258 115
      117 126 141 138 74 139 111 132 100 211 181 223 268 120
LJ06-181 apo cor NY 06-COR-NY-1 117 126 141 105 74 139 111 106 207 181 221 254 110
      117 126 141 138 83 139 111 120 211 193 221 254 115
LJ98-33 apo cor KS 90-COR-KS-2 117 126 141 99 74 133 111 112 90 209 173 221 256 105
      117 126 141 99 74 133 111 112 108 223 183 223 260 105
LJ09-903 apo cor NY Schreiner/Stone COR 117 141 105 74 139 111 110 90 209 177 221 268 115
      117 141 105 83 139 111 110 94 217 177 221 274 115
LJ06-18 apo ill TX Western 114 120 138 93 83 115 117 86 104 213 171 235 242 160
      114 135 138 108 83 115 123 86 104 219 189 259 244 165
LJ06-62 apo/apo xbr IL Abbott Thinshell 114 132 138 93 83 115 109 82 106 207 173 211 242 115
      117 132 141 99 89 133 111 82 106 219 185 257 270 160
LJ06-105 apo/apo xbr OK Pleas 114 132 138 114 83 115 111 96 104 203 175 221 244 115
      117 132 141 144 83 139 129 96 118 209 191 237 244 160
LJ10-4160 apo/car xio MX Stone 4160 108 132 138 93 80 85 111 86 94 217 177 247 228 105
      114 132 138 108 80 115 115 96 104 233 179 247 240 160
         114           
LJ06-55 apo/car xio TX 89-XIO-RDM-1 108 120 138 108 80 85 111 86 92 205 175 225 230 105
      114 120 138 108 83 115 117 94 104 219 189 259 242 160
LJ06-115 apo/car xla KY Jones Hybrid 108 132 138 108 80 85 111 98 94 217 175 219 234 105
      108 132 138 117 80 115 111 100 100 243 191 219 240 105
LJ06-180 apo/car xla NY C– × laneyi type 108 120 138 99 89 85 111 108 120 207 169 223 238 110
      117 126 138 138 89 139 111 114 120 209 169 225 280 110
LJ06-42 apo/car xnu IN McCallister 114 132 138 102 80 85 111 88 104 203 165 233 228 105
      114 132 138 102 83 115 115 104 114 231 177 239 250 160
LJ06-114 apo/car xnu MO Wilson 114 129 138 105 80 85 111 104 106 227 169 229 228 105
      114 129 138 108 83 115 111 110 114 231 175 255 242 150
LJ01-453 car lac KY Stevens (LAC) 114 132 138 105 83 85 111 94 94 227 171 229 226 100
      114 132 141 120 83 85 115 104 102 245 177 235 228 110
LJ98-36 car lac IN Stephens(LAC) 114 123 138 96 80 85 111 96 94 227 171 229 226 100
      114 129 141 99 80 115 111 104 102 245 177 235 228 105
LJ06-43 car lac Nieman 108 132 138 93 80 85 111 102 92 213 179 229 228 105
      114 132 144 93 80 85 111 104 94 215 179 233 228 110
LJ06-44 car lac IL Lindauer 114 132 138 93 80 85 109 94 92 225 183 229 228 105
      114 132 138 93 80 115 111 94 102 225 191 233 228 105
LJ09-905 car ovt NY Schreiner/Stone OVT 108 129 138 114 80 85 111 94 90 233 163 219 226 100
      108 129 138 120 80 85 111 96 94 235 173 251 226 105
LJ10-103 car ovt TX 10OVT-6 108 129 138 123 80 85 111 94 94 225 163 219 226 105
      111 129 138 123 80 117 111 94 94 225 175 229 226 105
LJ10-104 car ovt TX 10OVT-W1 108 129 138 123 80 85 111 94 94 225 163 219 226 105
      111 129 138 123 80 117 111 94 94 225 175 229 226 105
LJ06-89 car ovt LA 01-OVT-LA-2–1 108 129 138 108 80 85 111 94 94 213 173 219 226 105
      108 129 138 117 80 139 111 96 124 213 175 221 234 110
LJ98-38 car ovt LA 91-OVT-LA-1 108 129 138 93 80 85 111 94 92 225 163 219 230 105
      108 132 138 120 80 115 111 96 92 225 183 239 230 105
LJ06-67 car ovt PA Seas 108 120 138 93 80 85 111 96 94 221 175 219 226 105
      114 120 138 93 80 85 111 104 94 221 179 235 234 110
LJ10-4131 car ovt MX Stone 4131 108 129 138 99 80 85 111 94 94 223 169 225 228 105
      108 129 138 114 80 85 111 96 134 225 187 233 228 110
LJ10-4161 car ovt MX Stone 4161 108 126 138 114 80 85 111 96 94 217 169 225 226 105
      111 132 138 123 80 139 111 96 94 219 173 241 228 105
LJ06-102 car ovt TN Grainger 108 126 138 105 80 85 109 94 94 209 183 225 226 105
      114 129 138 114 80 85 111 102 106 227 191 231 244 105
         117           
         120           
LJ06-113 car ovt OH Yoder 1 108 120 138 108 80 115 109 102 94 229 171 235 226 105
      114 132 138 108 80 115 111 102 94 229 185 245 234 105
LJ06-100 car ovt IL 01-OVT-IL-8–3 108 129 138 117 80 85 109 100 96 219 163 223 228 105
      114 129 138 117 80 85 111 100 106 225 177 223 228 105
LJ09-1816 car tom MO Scarit 1816 TOM 108 120 138 108 80 85 111 104 94 169 225 238 110
      114 132 141 120 89 115 111 110 104 179 233 240 115
         126         237 244 120
                 253   
LJ09-1814 car tex MO Scarit 1814 TEX 108 141 98 80 85 107 100 94 167 225 226 110
      108 144 108 80 115 111 100 104 169 233 254 115
         129    113     171 237   
                179    
LJ09-828 car flo FL 09FLA-ABS1 108 120 138 99 77 115 111 98 94 217 171 225 234
      108 132 141 99 80 139 111 102 112 223 181 227 238
       138 144        227 185   248  
               233    290  
LJ09-1812 car/car xco MO Scarit 1812 XCO 108 120 138 102 77 85 111 90 175 226 105
      114 132 138 114 80 115 119 104 175 228 115
  1. Profiles for Stone 4131, 4160 and 4161, are matched by herbarium vouchers with those numbers in the Duke Herbarium
  2. Profiles for Scarit 1812, 1814 and 1816 are matched by herbarium vouchers with those numbers in the Duke Herbarium
  3. Section Apocarya = apo; Section Carya = car; hybrids by Sections = apo/apo, apo/car, or car/car; Species: C. aquatica = aqu; C. cordiformis = cor; C. illinoinensis = ill, C. floridana = flo; C. laciniosa = lac; C. ovata = ovt; C. texana = tex; C. tomentosa = tom; C. × brownii = xbr (ill × cor); C. × collina = xco (tom × tex), C. illinoinensis × C. ovata = xio, C. × nussbaumeri = xnu (lac × ill), C. × laneyi = xla (cor × ovt)