Table 2 Gene copy number (GCN) for tRNA genes in six Streptomyces genomes
S. coelicolor | S. albus | S. venezuelae | S. lividans | S. ghanaensis | S. clavuligerus | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
tF | tN | tF | tN | tF | tN | tF | tN | tF | tN | tF | tN | |
D 2 | ||||||||||||
F | 1 | 11 | 1 | 12 | 1 | 13 | 1 | 9 | 1 | 12 | 1 | 13 |
Y | 1 | 8 | 1 | 9 | 1 | 9 | 1 | 8 | 1 | 9 | 1 | 9 |
H | 1 | 12 | 1 | 12 | 1 | 13 | 1 | 12 | 1 | 13 | 1 | 12 |
Q | 2 | 10 | 3 | 14 | 3 | 14 | 2 | 10 | 3 | 16 | 2 | 15 |
N | 2 | 12 | 2 | 12 | 2 | 12 | 2 | 12 | 2 | 12 | 2 | 12 |
K | 4 | 17 | 4 | 19 | 4 | 17 | 4 | 17 | 4 | 18 | 4 | 18 |
D | 2 | 16 | 2 | 16 | 2 | 17 | 2 | 14 | 2 | 16 | 2 | 14 |
E | 4 | 15 | 4 | 16 | 4 | 16 | 4 | 15 | 4 | 16 | 4 | 17 |
C | 1 | 8 | 2 | 8 | 2 | 8 | 1 | 8 | 2 | 8 | 1 | 8 |
D 4 | ||||||||||||
A | 4 | 29 | 4 | 28 | 5 | 28 | 4 | 27 | 5 | 32 | 4 | 30 |
V | 6 | 28 | 6 | 29 | 6 | 29 | 4 | 28 | 6 | 33 | 4 | 29 |
T | 4 | 27 | 4 | 27 | 4 | 26 | 4 | 27 | 4 | 27 | 4 | 26 |
P | 5 | 19 | 4 | 20 | 4 | 22 | 5 | 19 | 5 | 20 | 5 | 20 |
G | 5 | 22 | 5 | 23 | 5 | 24 | 5 | 20 | 5 | 24 | 5 | 24 |
D 6 | ||||||||||||
S | 4 | 27 | 4 | 28 | 4 | 28 | 4 | 27 | 4 | 28 | 4 | 27 |
L | 6 | 25 | 6 | 26 | 7 | 24 | 6 | 23 | 7 | 26 | 6 | 26 |
R | 4 | 19 | 4 | 20 | 4 | 18 | 4 | 19 | 4 | 22 | 4 | 20 |
D 3 | ||||||||||||
I | 1 | 16 | 1 | 17 | 1 | 16 | 1 | 14 | 1 | 15 | 1 | 17 |
D 1 | ||||||||||||
M | 5 | 10 | 6 | 10 | 4 | 10 | 5 | 10 | 4 | 10 | 5 | 10 |
W | 1 | 6 | 1 | 7 | 1 | 7 | 1 | 6 | 1 | 8 | 1 | 7 |
Leu | ||||||||||||
TAA | 1 | 3 | 1 | 3 | 1 | 3 | 1 | 3 | 1 | 3 | 1 | 3 |
CAA | 1 | 10 | 1 | 11 | 1 | 9 | 1 | 10 | 1 | 10 | 1 | 10 |
GAG | 2 | 9 | 2 | 8 | 3 | 8 | 2 | 7 | 3 | 9 | 2 | 9 |
TAG | 1 | 2 | 1 | 3 | 1 | 3 | 1 | 2 | 1 | 3 | 1 | 3 |
CAG | 1 | 6 | 1 | 6 | 1 | 6 | 1 | 6 | 1 | 6 | 1 | 6 |