Table 5 List of universal primers and reaction conditions for candidate barcodes
Marker | Name of primers | Primer sequences 5′–3′ | PCR conditions | Production expected length (bp) |
|---|---|---|---|---|
ITS2 | S2F S3R | ATGCGATACTTGGTGTGAAT GACGCTTCTCCAGACTACAAT | 94 °C 5 min 94 °C 30 s, 56 °C 30 s, 72 °C 45 s, 40cycles, 72 °C 10 min | 491–561 |
rbcL | 1f 724r | ATGTCACCACAAACAGAAAC TCGCATGTACCTGCAGTAGC | 95 °C 2 min 94 °C 1 min, 55 °C 30 s, 72 °C 1 min, 34 cycles, 72 °C 7 min | 729–757 |
psbA-trnH | fwd PA rev TH | GTTATGCATGAACGTAATGCTC CGCGCATGGTGGATTCACAATCC | 94 °C 5 min 94 °C 1 min, 55 °C 1 min, 72 °C 1.5 min, 30 cycles, 72 °C 7 min | 364–470 |