Skip to main content

Table 1 PCR primers and amplification conditions

From: Identification, technological and safety characterization of Lactobacillus sakei and Lactobacillus curvatus isolated from Argentinean anchovies (Engraulis anchoita)

Primer

Sequence 5’→3’

References

PCR conditions *

   

Denaturing

Annealing

Extension

Cycles

PLB

AGAGTTTGATCCTGGCTCAG

Kullen et al. (2000)

    

MLB

GGCTGCTGGCACGTAGTTAG

 

94°C, 1 min

50°C, 1 min

72°C, 1 min

30

Bact 8 F

AGAGTTTGATCCTGGCTCAG

Edwards et al. (1989)

    

1391R

GACGGGCGGTGTGTRCA

Lane et al. (1985)

94°C, 1 min

56°C, 1 min

72°C, 1 min

30

16S/p2

CTTGTACACACCGCCCGTC

Gürtler and Stanisich (1996)

    

23S/p7

GGTACTTAGATGTTTCAGTTC

 

94°C, 1 min

56°C, 1 min

72°C, 1 min

35

CS-f

GAGCTTGCTCCTCATTGATAA

Lee et al. (2004)

    

CS-r

TTGGATACCGTCACTACCTG

     

Uni-f

GATAAACCAAATGTGTAGGG

 

94°C, 0.5 min

58°C, 0.5 min

72°C, 1 min

35

M13

GAG GGT GGC GGT TCT

Huey and Hall (1989)

94°C, 1 min

45°C, 0.2 min

72°C, 2 min

40

RAPD1

AGC AGG GTC G

Cocconcelli et al. (1995)

94°C, 1 min

29°C, 1 min

72°C, 2 min

20

RAPD2

AGC AGC GTG G

94°C, 0.5 min

55°C, 0.5 min

72°C, 0.3 min

45

  1. *All PCR programs included a first step of 94°C, 5 min and a final extension at 72°C, 5 min.